Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms