Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TIMM8AP1-201ENST00000419283 295 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC012377.1-202ENST00000558675 4811 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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HOXD11P31277 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 FGF5-201ENST00000312465 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 HDAC9-229ENST00000622668 4279 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SPATA31E3P-201ENST00000613133 4214 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SNCA-206ENST00000420646 3127 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC011474.3-201ENST00000587520 250 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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