Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRIM25Q14258 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms