Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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COL4A6Q14031 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL4A6Q14031 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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