Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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