Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCDHAC1-202ENST00000409700 4077 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TLDC1-201ENST00000343629 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH1L1-201ENST00000273450 3179 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CFAP65-207ENST00000441968 3416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAB21L3-201ENST00000369500 3229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 IFT172-201ENST00000260570 5415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC6A2-202ENST00000379906 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AMMECR1-202ENST00000372057 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC024610.2-204ENST00000637478 2867 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL031283.1-201ENST00000427824 5178 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EFCAB8-201ENST00000400522 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PMEL-206ENST00000548747 2757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 IDH3A-201ENST00000299518 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HADHAP2-201ENST00000540341 2285 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms