Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIN2BQ13224 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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