Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms