Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PITPNM1O00562 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PITPNM1O00562 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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