Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PHF23Q9BUL5 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PHF23Q9BUL5 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PHF23Q9BUL5 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PHF23Q9BUL5 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms