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| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-353P-201 | ENST00000364266 | 108 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SPANXN3-201 | ENST00000370503 | 590 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | DEFB110-201 | ENST00000371148 | 384 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC068339.2-201 | ENST00000534395 | 618 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC006518.2-202 | ENST00000544947 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | LINC02448-201 | ENST00000548613 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AL160191.1-201 | ENST00000555480 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC078909.1-201 | ENST00000559509 | 464 nt | TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SULT1C2P1-202 | ENST00000562418 | 459 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AP001542.2-201 | ENST00000593141 | 364 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | XIAPP1-201 | ENST00000603162 | 600 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | LINC00310-205 | ENST00000609062 | 863 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC018755.4-201 | ENST00000619715 | 454 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC009318.4-201 | ENST00000620496 | 486 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AL590240.3-201 | ENST00000621416 | 943 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | C8orf89-203 | ENST00000625134 | 507 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |