Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
GABRA6Q16445 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms