Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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