Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK1-204ENST00000399907 3472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011365.1-201ENST00000522615 3478 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 P2RX7-202ENST00000328963 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC2-201ENST00000357701 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-240ENST00000638575 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1683-207ENST00000600359 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP112-203ENST00000535342 3392 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MOV10L1-205ENST00000395858 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133367.1-201ENST00000568177 4063 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 COL25A1-202ENST00000399127 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC11A2-205ENST00000545993 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FOSB-202ENST00000417353 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00461-212ENST00000511014 3539 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC6-205ENST00000626395 2906 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PAPPA2-201ENST00000367661 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.4 ms