Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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