Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
E2F4Q16254 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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E2F4Q16254 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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E2F4Q16254 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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E2F4Q16254 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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