Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RAB35Q15286 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms