Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PDK3Q15120 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms