Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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