Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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