Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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FOXD1Q16676 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FOXD1Q16676 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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