Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK4Q16099 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK4Q16099 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK4Q16099 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK4Q16099 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK4Q16099 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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