Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SNPHO15079 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SNPHO15079 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms