Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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