Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SSPNQ14714 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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