Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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