Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SRSF5Q13243 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms