Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A4Q9Y6R1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms