Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP46A1Q9Y6A2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms