Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms