Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4BQ9Y4P1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms