Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms