Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCE1Q9Y256 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCE1Q9Y256 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms