Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms