Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms