Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED23Q9ULK4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms