Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG3Q9UJ98 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG3Q9UJ98 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms