Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAX2Q9UIW0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms