Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms