Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms