Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX1-2Q9UD57 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms