Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARHGAP28Q9P2N2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARHGAP28Q9P2N2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms