Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms