Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCHIP1Q9P0W5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCHIP1Q9P0W5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms