Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms