Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms