Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms