Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED17Q9NVC6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED17Q9NVC6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms