Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms