Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms